MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014002	GAG	2	6	1560058	1560063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014002	C	6	6	1560074	1560079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4503	NC_014002	CAAT	2	8	1560740	1560747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_014002	CATC	2	8	1560754	1560761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_014002	T	6	6	1560772	1560777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014002	TCT	2	6	1560819	1560824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014002	GAAG	2	8	1560930	1560937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014002	GAA	2	6	1560940	1560945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014002	AAT	2	6	1560983	1560988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014002	AGA	2	6	1561009	1561014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014002	TTAT	2	8	1561040	1561047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_014002	AAC	2	6	1561129	1561134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_014002	AATC	2	8	1561159	1561166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_014002	CATA	2	8	1561197	1561204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_014002	TGA	2	6	1561236	1561241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014002	TA	3	6	1561514	1561519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014002	AT	3	6	1561545	1561550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014002	ATC	2	6	1561556	1561561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_014002	A	7	7	1561565	1561571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014002	ATT	2	6	1561573	1561578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014002	TAT	2	6	1561590	1561595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_014002	AT	4	8	1561640	1561647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014002	CGGG	2	8	1561669	1561676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_014002	ATA	2	6	1561776	1561781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_014002	ATTA	2	8	1562656	1562663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014002	A	6	6	1562725	1562730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014002	CAAA	2	8	1562731	1562738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_014002	TCAT	2	8	1562749	1562756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_014002	AT	3	6	1562755	1562760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014002	ATA	2	6	1562765	1562770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014002	AGC	2	6	1562821	1562826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014002	ACC	3	9	1562838	1562846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_014002	ACC	2	6	1562849	1562854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_014002	T	7	7	1562862	1562868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014002	TAA	2	6	1563613	1563618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014002	AT	4	8	1563631	1563638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_014002	TCC	2	6	1565999	1566004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_014002	TTC	2	6	1568395	1568400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014002	TAT	2	6	1568415	1568420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014002	A	6	6	1568443	1568448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014002	ATATA	2	10	1568457	1568466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_014002	TA	3	6	1568471	1568476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014002	ATA	3	9	1568479	1568487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014002	TAAAGA	2	12	1568514	1568525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014002	GGT	2	6	1570019	1570024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014002	CAA	2	6	1570772	1570777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_014002	TA	3	6	1570789	1570794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_014002	AT	3	6	1573014	1573019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014002	ATA	2	6	1573036	1573041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014002	ATA	2	6	1573320	1573325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014002	T	7	7	1573328	1573334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014002	ACAT	2	8	1573337	1573344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_014002	AT	3	6	1573369	1573374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014002	CCT	2	6	1573421	1573426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_014002	T	6	6	1574961	1574966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014002	GAT	2	6	1576302	1576307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014002	ATT	2	6	1581253	1581258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014002	TAA	2	6	1581261	1581266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014002	TAA	2	6	1592635	1592640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014002	ATTTT	2	10	1592653	1592662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014002	TCT	2	6	1592666	1592671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_014002	ATC	2	6	1592677	1592682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_014002	A	6	6	1592732	1592737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014002	AAAAC	2	10	1592759	1592768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4565	NC_014002	TAAAA	2	10	1592780	1592789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_014002	A	8	8	1592786	1592793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_014002	AAT	2	6	1593812	1593817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014002	CCA	2	6	1593824	1593829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_014002	TAC	2	6	1593831	1593836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_014002	TAA	2	6	1593862	1593867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014002	CATCC	2	10	1593878	1593887	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4572	NC_014002	ACCT	2	8	1593918	1593925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_014002	TTA	2	6	1595424	1595429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014002	CTG	2	6	1597100	1597105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_014002	TAAA	2	8	1597110	1597117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014002	TTC	2	6	1597212	1597217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_014002	CTGC	2	8	1597218	1597225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_014002	AT	4	8	1597336	1597343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014002	AATG	2	8	1601444	1601451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014002	AAT	2	6	1601461	1601466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014002	TCC	2	6	1601476	1601481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_014002	AT	3	6	1601482	1601487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014002	TAC	2	6	1601490	1601495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_014002	TAA	2	6	1601506	1601511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014002	AT	4	8	1601533	1601540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_014002	TTA	2	6	1601552	1601557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_014002	TG	3	6	1601634	1601639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_014002	TGC	2	6	1601697	1601702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4590	NC_014002	CTT	2	6	1603027	1603032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_014002	TCAA	2	8	1604419	1604426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_014002	AAT	2	6	1604431	1604436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014002	GTT	2	6	1604468	1604473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014002	A	6	6	1604484	1604489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_014002	AGGA	2	8	1605747	1605754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014002	CCTG	2	8	1605757	1605764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_014002	AAT	2	6	1608336	1608341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014002	ATCC	2	8	1608774	1608781	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_014002	CT	3	6	1608782	1608787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_014002	A	6	6	1608790	1608795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014002	TA	3	6	1608809	1608814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014002	AT	3	6	1608845	1608850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014002	TAAA	2	8	1608851	1608858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014002	TA	3	6	1611401	1611406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014002	T	7	7	1611923	1611929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014002	GAA	2	6	1613199	1613204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014002	TTAA	2	8	1613217	1613224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_014002	GTA	2	6	1613338	1613343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014002	ATTC	2	8	1613363	1613370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_014002	A	6	6	1613403	1613408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014002	AAT	2	6	1613457	1613462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014002	AAT	2	6	1613503	1613508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014002	TAT	2	6	1613699	1613704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014002	AGC	2	6	1613711	1613716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014002	CTC	2	6	1613717	1613722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_014002	AAT	2	6	1613756	1613761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014002	TAC	2	6	1613784	1613789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014002	A	6	6	1614267	1614272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014002	AT	3	6	1614340	1614345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014002	ATA	2	6	1614363	1614368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014002	AGG	2	6	1614372	1614377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014002	T	6	6	1614380	1614385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_014002	AATT	2	8	1616233	1616240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_014002	GAT	2	6	1616246	1616251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014002	TCT	2	6	1618163	1618168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_014002	TTA	2	6	1618188	1618193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014002	ATA	2	6	1619316	1619321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_014002	AGC	2	6	1619366	1619371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_014002	T	6	6	1621369	1621374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_014002	ATT	2	6	1623623	1623628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_014002	GA	3	6	1623639	1623644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_014002	ATA	2	6	1623684	1623689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_014002	AAC	2	6	1624407	1624412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_014002	TAAT	2	8	1624451	1624458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_014002	TA	3	6	1624461	1624466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_014002	TAC	2	6	1624501	1624506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4638	NC_014002	TA	3	6	1624716	1624721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4639	NC_014002	CG	3	6	1624798	1624803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4650	NC_014002	ACTCA	2	10	1633339	1633348	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4658	NC_014002	TA	3	6	1642166	1642171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4754	NC_014002	TCC	2	6	1676258	1676263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4759	NC_014002	ATG	2	6	1683265	1683270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4762	NC_014002	TAAAA	2	10	1683343	1683352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4764	NC_014002	ACCAA	2	10	1684924	1684933	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4766	NC_014002	TTATT	2	10	1684993	1685002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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